MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_015183	GTGGCG	2	12	2811281	2811292	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325294194
54502	NC_015183	CGC	2	6	2811312	2811317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294194
54503	NC_015183	AGC	2	6	2811431	2811436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294194
54504	NC_015183	GAA	2	6	2811483	2811488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294194
54505	NC_015183	ACG	2	6	2811670	2811675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294194
54506	NC_015183	ACG	2	6	2811704	2811709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294194
54507	NC_015183	GC	3	6	2811817	2811822	0 %	0 %	50 %	50 %	325294194
54508	NC_015183	CAGC	2	8	2811865	2811872	25 %	0 %	25 %	50 %	325294194
54509	NC_015183	CCG	2	6	2811935	2811940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294194
54510	NC_015183	CGA	2	6	2811945	2811950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294194
54511	NC_015183	GCA	2	6	2811978	2811983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294194
54512	NC_015183	TCGG	2	8	2812019	2812026	0 %	25 %	50 %	25 %	325294194
54513	NC_015183	CGC	2	6	2812027	2812032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294194
54514	NC_015183	CA	4	8	2812096	2812103	50 %	0 %	0 %	50 %	325294194
54515	NC_015183	GA	3	6	2812124	2812129	50 %	0 %	50 %	0 %	325294194
54516	NC_015183	CGG	2	6	2812134	2812139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294194
54517	NC_015183	TGC	2	6	2812146	2812151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294194
54518	NC_015183	CTT	2	6	2812274	2812279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294195
54519	NC_015183	A	6	6	2812295	2812300	100 %	0 %	0 %	0 %	325294195
54520	NC_015183	GCC	2	6	2812310	2812315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294195
54521	NC_015183	CGG	2	6	2812357	2812362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294195
54522	NC_015183	ATC	2	6	2812437	2812442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294195
54523	NC_015183	CGAG	2	8	2812462	2812469	25 %	0 %	50 %	25 %	325294195
54524	NC_015183	GCC	2	6	2812490	2812495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294195
54525	NC_015183	CCA	2	6	2812501	2812506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294195
54526	NC_015183	CAG	2	6	2812578	2812583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294195
54527	NC_015183	AGA	2	6	2812632	2812637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294195
54528	NC_015183	GGC	2	6	2812729	2812734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294195
54529	NC_015183	GCC	2	6	2812802	2812807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294195
54530	NC_015183	CCA	2	6	2812892	2812897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294195
54531	NC_015183	CTT	2	6	2813012	2813017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294195
54532	NC_015183	GCA	2	6	2813119	2813124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294195
54533	NC_015183	TGCGC	2	10	2813289	2813298	0 %	20 %	40 %	40 %	325294195
54534	NC_015183	TGA	2	6	2813313	2813318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294195
54535	NC_015183	AGC	2	6	2813352	2813357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294195
54536	NC_015183	GGC	2	6	2813366	2813371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294195
54537	NC_015183	GC	3	6	2813395	2813400	0 %	0 %	50 %	50 %	325294195
54538	NC_015183	GC	3	6	2813443	2813448	0 %	0 %	50 %	50 %	325294195
54539	NC_015183	TTTTC	2	10	2813497	2813506	0 %	80 %	0 %	20 %	325294195
54540	NC_015183	GCC	2	6	2813514	2813519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294195
54541	NC_015183	GCA	2	6	2813544	2813549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294195
54542	NC_015183	T	6	6	2813615	2813620	0 %	100 %	0 %	0 %	325294195
54543	NC_015183	GCC	2	6	2813798	2813803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294196
54544	NC_015183	TGA	3	9	2813868	2813876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294196
54545	NC_015183	AAGC	2	8	2813958	2813965	50 %	0 %	25 %	25 %	325294196
54546	NC_015183	CCG	2	6	2813995	2814000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294196
54547	NC_015183	GCG	2	6	2814057	2814062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294196
54548	NC_015183	ATC	2	6	2814068	2814073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294196
54549	NC_015183	ATT	2	6	2814103	2814108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325294196
54550	NC_015183	GTT	2	6	2814109	2814114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325294196
54551	NC_015183	CCA	2	6	2814125	2814130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294196
54552	NC_015183	CTT	2	6	2814249	2814254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294196
54553	NC_015183	CAG	2	6	2814271	2814276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294196
54554	NC_015183	GGC	2	6	2814286	2814291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294196
54555	NC_015183	TTC	2	6	2814312	2814317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294196
54556	NC_015183	GA	3	6	2814389	2814394	50 %	0 %	50 %	0 %	325294196
54557	NC_015183	CAG	2	6	2814504	2814509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294196
54558	NC_015183	ATC	2	6	2814524	2814529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294196
54559	NC_015183	GCC	2	6	2814532	2814537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294196
54560	NC_015183	CCG	2	6	2814542	2814547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294196
54561	NC_015183	CAT	2	6	2814607	2814612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294196
54562	NC_015183	CGG	3	9	2814790	2814798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294197
54563	NC_015183	GAAG	2	8	2814809	2814816	50 %	0 %	50 %	0 %	325294197
54564	NC_015183	GAA	2	6	2814819	2814824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294197
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54566	NC_015183	CGG	2	6	2814866	2814871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294197
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54568	NC_015183	GCT	2	6	2815036	2815041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294198
54569	NC_015183	GC	5	10	2815294	2815303	0 %	0 %	50 %	50 %	325294198
54570	NC_015183	GAT	2	6	2815403	2815408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294198
54571	NC_015183	CTT	2	6	2815468	2815473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294198
54572	NC_015183	CGA	2	6	2815507	2815512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294198
54573	NC_015183	GTC	2	6	2815535	2815540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294198
54574	NC_015183	CG	3	6	2815589	2815594	0 %	0 %	50 %	50 %	325294198
54575	NC_015183	GAC	2	6	2815720	2815725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294198
54576	NC_015183	GCGA	2	8	2815742	2815749	25 %	0 %	50 %	25 %	325294198
54577	NC_015183	GC	3	6	2815785	2815790	0 %	0 %	50 %	50 %	325294198
54578	NC_015183	CACC	2	8	2815798	2815805	25 %	0 %	0 %	75 %	325294198
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54582	NC_015183	CT	4	8	2815935	2815942	0 %	50 %	0 %	50 %	325294199
54583	NC_015183	TC	3	6	2816075	2816080	0 %	50 %	0 %	50 %	325294199
54584	NC_015183	ACC	2	6	2816104	2816109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294199
54585	NC_015183	TGC	2	6	2816110	2816115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294199
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54587	NC_015183	CAG	2	6	2816208	2816213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294199
54588	NC_015183	AGC	2	6	2816271	2816276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294199
54589	NC_015183	GGGC	2	8	2816310	2816317	0 %	0 %	75 %	25 %	325294199
54590	NC_015183	CCT	2	6	2816348	2816353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325294199
54591	NC_015183	AAAG	2	8	2816375	2816382	75 %	0 %	25 %	0 %	325294199
54592	NC_015183	AGA	2	6	2816422	2816427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294199
54593	NC_015183	TCG	2	6	2816432	2816437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294199
54594	NC_015183	CTG	2	6	2816462	2816467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294199
54595	NC_015183	CACC	2	8	2816498	2816505	25 %	0 %	0 %	75 %	325294199
54596	NC_015183	AGA	2	6	2816506	2816511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294199
54597	NC_015183	GAA	2	6	2816518	2816523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294199
54598	NC_015183	GATCAA	2	12	2816576	2816587	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325294199
54599	NC_015183	GCC	2	6	2816611	2816616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294199
54600	NC_015183	CGT	2	6	2816640	2816645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294199
54601	NC_015183	T	7	7	2816692	2816698	0 %	100 %	0 %	0 %	325294199
54602	NC_015183	AAC	2	6	2816761	2816766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325294200
54603	NC_015183	ATT	2	6	2816884	2816889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325294200
54604	NC_015183	AT	3	6	2816906	2816911	50 %	50 %	0 %	0 %	325294200
54605	NC_015183	ATCGC	2	10	2816951	2816960	20 %	20 %	20 %	40 %	325294200
54606	NC_015183	CTGA	2	8	2816993	2817000	25 %	25 %	25 %	25 %	325294200
54607	NC_015183	TTG	2	6	2817062	2817067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325294200
54608	NC_015183	CCG	3	9	2817137	2817145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325294200
54609	NC_015183	CCA	2	6	2817246	2817251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325294200
54610	NC_015183	CTT	2	6	2817271	2817276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294200
54611	NC_015183	CGA	2	6	2817285	2817290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294200
54612	NC_015183	AGC	2	6	2817418	2817423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294201
54613	NC_015183	GCA	2	6	2817430	2817435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294201
54614	NC_015183	GA	3	6	2817514	2817519	50 %	0 %	50 %	0 %	325294201
54615	NC_015183	ACG	2	6	2817738	2817743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294201
54616	NC_015183	AGC	2	6	2817777	2817782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294201
54617	NC_015183	GGGA	2	8	2817785	2817792	25 %	0 %	75 %	0 %	325294201
54618	NC_015183	TCA	2	6	2817809	2817814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294201
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54621	NC_015183	ATC	2	6	2818009	2818014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294201
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54624	NC_015183	ATG	2	6	2818240	2818245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294201
54625	NC_015183	TG	3	6	2818332	2818337	0 %	50 %	50 %	0 %	325294201
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54628	NC_015183	CGT	2	6	2818506	2818511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325294201
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54632	NC_015183	CAACA	2	10	2818788	2818797	60 %	0 %	0 %	40 %	325294201
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54647	NC_015183	GGCG	2	8	2819488	2819495	0 %	0 %	75 %	25 %	325294202
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54726	NC_015183	GC	3	6	2823056	2823061	0 %	0 %	50 %	50 %	325294205
54727	NC_015183	GAT	2	6	2823070	2823075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294205
54728	NC_015183	CGG	2	6	2823192	2823197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325294205
54729	NC_015183	CAGC	2	8	2823204	2823211	25 %	0 %	25 %	50 %	325294205
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